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Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz

Publikationsart: Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz
Autor(en): Ana B. Abecasis; Annemarie M. J. Wensing; Dimitris Paraskevis; Jurgen Vercauteren; Kristof Theys; David A. M. C. van de Vijver; Jan Albert; Birgitta Asjö; Claudia Balotta; Danail Beshkov; Ricardo J. Camacho; Bonaventura Clotet; Cillian De Gascun; Algis Griskevicius; Zehava Grossman; Osamah Hamouda; Andrzej Horban; Tatjana Kolupajeva; Klaus Korn; Leon G. Kostrikis; Claudia Kücherer
Titel: HIV-1 subtype distribution and its demographic determinants in newly diagnosed patients in Europe suggest highly compartmentalized epidemics
Erschienen in: Retrovirology 10 (7) , 2013
S. 1-13
Verlag: BioMedCentral
Verlags-URL: http://www.retrovirology.com/content/10/1/7
DOI: 10.1186/1742-4690-10-7
Veröffentlichung auf edoc: 01.03.2013
Status: published
Volltext: pdf (urn:nbn:de:0257-10029444)
Schlagwörter (eng): Humans, Female, Male, Bayes Theorem, Risk Factors, HIV Infections/epidemiology, HIV Infections/virology, Europe/epidemiology, HIV-1/genetics, Epidemics, HIV-1/classification, Risk-Taking, Social Behavior, Socioeconomic Factors
Vorhaben/Arbeitsgruppe: Robert Koch-Institut, Infektionsepidemiologie
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Abstract (eng):
Background: Understanding HIV-1 subtype distribution and epidemiology can assist preventive measures and clinical decisions. Sequence variation may affect antiviral drug resistance development, disease progression, evolutionary rates and transmission routes.
Results: We investigated the subtype distribution of HIV-1 in Europe and Israel in a representative sample of patients diagnosed between 2002 and 2005 and related it to the demographic data available. 2793 PRO-RT sequences were subtyped either with the REGA Subtyping tool or by a manual procedure that included phylogenetic tree and recombination analysis. The most prevalent subtypes/CRFs in our dataset were subtype B (66.1%), followed by sub-subtype A1 (6.9%), subtype C (6.8%) and CRF02_AG (4.7%). Substantial differences in the proportion of new diagnoses with distinct subtypes were found between European countries: the lowest proportion of subtype B was found in Israel (27.9%) and Portugal (39.2%), while the highest was observed in Poland (96.2%) and Slovenia (93.6%). Other subtypes were significantly more diagnosed in immigrant populations. Subtype B was significantly more diagnosed in men than in women and in MSM > IDUs > heterosexuals. Furthermore, the subtype distribution according to continent of origin of the patients suggests they acquired their infection there or in Europe from compatriots.
Conclusions: The association of subtype with demographic parameters suggests highly compartmentalized epidemics, determined by social and behavioural characteristics of the patients.
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Generiert am 30.04.2017, 14:41:43