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Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz

Publikationsart: Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz
Autor(en): Eva Schunder; Kerstin Rydzewski; Roland Grunow; Klaus Heuner
Titel: First indication for a functional CRISPR/Cas system in Francisella tularensis
Erschienen in: International Journal of Medical Microbiology 303 (2) , 2013
S. 51-60
Verlag: Elsevier
Verlagshinweis: Eva Schunder, Kerstin Rydzewski, Roland Grunow, Klaus Heuner
First indication for a functional CRISPR/Cas system in Francisella tularensis
International Journal of Medical Microbiology, Volume 303, Issue 2, March 2013, Pages 51-60.
Verlags-URL: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1438422112000902
DOI: 10.1016/j.ijmm.2012.11.004
Veröffentlichung auf edoc: 06.02.2014
Status: published
Volltext: pdf (urn:nbn:de:0257-10034873)
Schlagwörter (eng): Nucleic Acid, Sequence Analysis DNA, Plasmids, Genome Bacterial, Bacteriophages/genetics, Computational Biology, Francisella tularensis/genetics, Repetitive Sequences
Vorhaben/Arbeitsgruppe: Robert Koch-Institut, Biologische Sicherheit
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Abstract (eng):
Francisella tularensis is a zoonotic agent and the subspecies novicida is proposed to be a water-associated bacterium. The intracellular pathogen F. tularensis causes tularemia in humans and is known for its potential to be used as a biological threat. We analyzed the genome sequence of F. tularensis subsp. novicida U112 in silico for the presence of a putative functional CRISPR/Cas (clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated) system. CRISPR/Cas systems are known to encode an RNA-guided adaptive immunity-like system to protect bacteria against invading genetic elements like bacteriophages and plasmids. In this work, we present a first indication that F. tularensis subsp. novicida encodes a functional CRISPR/Cas defence system. Additionally, we identified various spacer DNAs homologous to a putative phage present within the genome of F. tularensis subsp. novicida-like strain 3523. CRISPR/Cas is also present in F. tularensis subsp. tularensis, holarctica, and mediasiatica, but these systems seem to be non-functional.
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Generiert am 26.05.2017, 01:48:45