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Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz

Publikationsart: Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz
Autor(en): Sebastian Haller; Christoph Eller; Julia Hermes; Martin Kaase; Matthias Steglich; Aleksandar Radonić; Piotr Wojtek Dabrowski; Andreas Nitsche; Yvonne Pfeifer; Guido Werner; Werner Wunderle; Edward Velasco; Muna Abu Sin; Tim Eckmanns; Ulrich Nübel
Titel: What caused the outbreak of ESBL-producing Klebsiella pneumoniae in a neonatal intensive care unit, Germany 2009 to 2012? Reconstructing transmission with epidemiological analysis and whole-genome sequencing
Erschienen in: BMJ Open 5 (e007397) , 2015
S. 1-9
Verlag: BMJ Publishing Group
Verlagshinweis: Haller S, Eller C, Hermes J, et al.
What caused the outbreak of ESBLproducing Klebsiella pneumoniae in a neonatal intensive care unit, Germany 2009 to 2012? Reconstructing transmission with epidemiological analysis and whole-genome sequencing.
BMJ Open 2015;5:e007397.
Verlags-URL: http://bmjopen.bmj.com/content/5/5/e007397
DOI: 10.1136/bmjopen-2014-007397
Veröffentlichung auf edoc: 18.05.2015
Status: published
Volltext: pdf (urn:nbn:de:0257-10039487)
Schlagwörter (eng): Humans, Female, Male, Biological Evolution, Germany/epidemiology, Cohort Studies, Phylogeny, Sequence Analysis DNA, Genome Bacterial, Disease Outbreaks, Retrospective Studies, Infant Newborn, beta-Lactamases/metabolism, Endemic Diseases, Intensive Care Units Neonatal, Klebsiella Infections/epidemiology, Klebsiella Infections/microbiology, Klebsiella Infections/transmission, Klebsiella pneumoniae/genetics, Klebsiella pneumoniae/metabolism
Vorhaben/Arbeitsgruppe: Robert Koch-Institut, Infektionskrankheiten / Erreger
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Abstract (eng):
Objective: We aimed to retrospectively reconstruct the timing of transmission events and pathways in order to understand why extensive preventive measures and investigations were not sufficient to prevent new cases.
Methods: We extracted available information from patient charts to describe cases and to compare them to the normal population of the ward. We conducted a cohort study to identify risk factors for pathogen acquisition. We sequenced the available isolates to determine the phylogenetic relatedness of Klebsiella pneumoniae isolates on the basis of their genome sequences.
Results: The investigation comprises 37 cases and the 10 cases with ESBL (extended-spectrum beta-lactamase)-producing K. pneumoniae bloodstream infection. Descriptive epidemiology indicated that a continuous transmission from person to person was most likely. Results from the cohort study showed that ‘frequent manipulation’ (a proxy for increased exposure to medical procedures) was significantly associated with being a case (RR 1.44, 95% CI 1.02 to 2.19). Genome sequences revealed that all 48 bacterial isolates available for sequencing from 31 cases were closely related (maximum genetic distance, 12 single nucleotide polymorphisms). Based on our calculation of evolutionary rate and sequence diversity, we estimate that the outbreak strain was endemic since 2008.
Conclusions: Epidemiological and phylogenetic analyses consistently indicated that there were additional, undiscovered cases prior to the onset of microbiological screening and that the spread of the pathogen remained undetected over several years, driven predominantly by person-to-person transmission. Whole-genome sequencing provided valuable information on the onset, course and size of the outbreak, and on possible ways of transmission.
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Generiert am 19.10.2017, 07:22:31