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Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz

Publikationsart: Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz
Autor(en): Torsten Semmler; Ewan M. Harrison; Antina Lübke-Becker; Rainer G. Ulrich; Lothar H. Wieler; Sebastian Guenther; Ivonne Stamm; Anne-Merethe Hanssen; Mark A. Holmes; Szilvia Vincze; Birgit Walther
Titel: A Look into the Melting Pot: The mecC-Harboring Region Is a Recombination Hot Spot in Staphylococcus stepanovicii
Erschienen in: PLoS ONE 11 (1) , 2016
S. 1-12
Verlag: Public Library of Science
Verlagshinweis: Semmler T, Harrison EM, Lübke-Becker A, Ulrich RG, Wieler LH, Guenther S, et al. (2016)
A Look into the Melting Pot: The mecC-Harboring Region Is a Recombination Hot Spot in Staphylococcus stepanovicii.
PLoS ONE 11(1): e0147150.
Verlags-URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0147150
DOI: 10.1371/journal.pone.0147150
Veröffentlichung auf edoc: 25.01.2016
Status: published
Volltext: pdf (urn:nbn:de:0257-10042806)
Schlagwörter (eng): Recombination Genetic, Genes Bacterial, Staphylococcus/genetics
Vorhaben/Arbeitsgruppe: Robert Koch-Institut
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Abstract (eng):
Introduction: Horizontal gene transfer (HGT) is an important driver for resistance- and virulence factor accumulation in pathogenic bacteria such as Staphylococcus aureus.
Methods: Here, we have investigated the downstream region of the bacterial chromosomal attachment site (attB) for the staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) element of a commensal mecC-positive Staphylococcus stepanovicii strain (IMT28705; ODD4) with respect to genetic composition and indications of HGT. S. stepanovicii IMT28705 was isolated from a fecal sample of a trapped wild bank vole (Myodes glareolus) during a screening study (National Network on “Rodent-Borne Pathogens”) in Germany. Whole genome sequencing (WGS) of IMT28705 together with the mecC-negative type strain CM7717 was conducted in order to comparatively investigate the genomic region downstream of attB (GenBank accession no. KR732654 and KR732653).
Results: The bank vole isolate (IMT28705) harbors a mecC gene which shares 99.2% nucleotide (and 98.5% amino acid) sequence identity with mecC of MRSA_LGA251. In addition, the mecC-encoding region harbors the typical blaZ-mecC-mecR1-mecI structure, corresponding with the class E mec complex. While the sequences downstream of attB in both S. stepanovicii isolates (IMT28705 and CM7717) are partitioned by 15 bp direct repeats, further comparison revealed a remarkable low concordance of gene content, indicating a chromosomal “hot spot” for foreign DNA integration and exchange.
Conclusion: Our data highlight the necessity for further research on transmission routes of resistance encoding factors from the environmental and wildlife resistome.
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Generiert am 13.12.2017, 05:54:06