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Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz

Publikationsart: Veröffentlichter Artikel oder Aufsatz
Autor(en): Sadegh Chinikar; Nariman Shah-Hosseini; Saeid Bouzari; Mohammad Ali Shokrgozar; Ehsan Mostafavi; Tahmineh Jalali; Sahar Khakifirouz; Martin H. Groschup; Matthias Niedrig
Titel: Assessment of Recombination in the S-segment Genome of Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus in Iran
Erschienen in: Journal of Arthropod-Borne Diseases 10 (1) , 2016
S. 12-23
Verlag: Tehran University of Medical Sciences
Verlags-URL: http://jad.tums.ac.ir/index.php/jad/article/view/288
Veröffentlichung auf edoc: 10.08.2016
Status: published
Volltext: pdf (urn:nbn:de:0257-10046431)
Schlagwörter (eng): Phylogenetic, Recombination, Diversity, Crimean Congo Hemorrhagic Fever, Iran
Vorhaben/Arbeitsgruppe: Robert Koch-Institut, Biologische Sicherheit
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Abstract (eng):
Background: Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus (CCHFV) belongs to genus Nairovirus and family Bunyaviridae. The main aim of this study was to investigate the extent of recombination in S-segment genome of CCHFV in Iran.
Methods: Samples were isolated from Iranian patients and those available in GenBank, and analyzed by phyloge­netic and bootscan methods.
Results: Through comparison of the phylogenetic trees based on full length sequences and partial fragments in the S-segment genome of CCHFV, genetic switch was evident, due to recombination event. Moreover, evidence of multi­ple recombination events was detected in query isolates when bootscan analysis was used by SimPlot software.
Conclusion: Switch of different genomic regions between different strains by recombination could contribute to CCHFV diversification and evolution. The occurrence of recombination in CCHFV has a critical impact on epidemi­ological investigations and vaccine design.
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Generiert am 25.06.2017, 10:24:24