Untersuchungen zur Rolle der RNA-Transportproteine Rec von HERV-K und REV von HIV-1 bei der Virusassemblierung
Liedgens, Linda
Diese Arbeit beschäftigt sich mit den RNA-Transportproteinen Rec des humanen endogenen Retrovirus K (HERV-K) und Rev des humanen Immundefizienz-Virus 1 (HIV-1) und ihrer Rolle während des nukleozytoplasmatischen RNA-Transports und der Virusassemblierung.
Um ihrer Rolle als RNA-Transportproteine gerecht zu werden, müssen HERV-K Rec und HIV-1 Rev mit einer Vielzahl von Wirtsproteinen interagieren. Es wurde vor allem das Zusammenspiel mit möglichen Interaktionspartnern wie dem RNA-Transportprotein Staufen-1 oder dem antiviralen hochmolekularen APOBEC3G (apolipoprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide 1-like) untersucht.
Co-Immunpräzipitationsversuche konnten eine bereits gezeigte Interaktion zwischen HERV-K Rec und Staufen-1 auch für das HIV-1 Rev nachweisen. Die spezifische Interaktion, die hierbei zwischen Staufen-1 und HIV-1 Rev nachgewiesen wurde, konnte durch Immunfluoreszenzversuche bestätigt werden.
Es soll untersucht werden, ob die Interaktion von Staufen-1 und den RNA-Transportproteinen Rec und Rev möglicherweise einen antiviralen Kontrollmechanismus der Wirtszelle darstellt, indem HIV-1 Rev und HERV-K Rec über die Interaktion mit dem Staufen-1 in Stressgranula und antivirale HMM APOBEC3G-Komplexe rekrutiert und dort regulatorischen Mechanismen unterworfen werden.
Die räumliche Nähe von HERV-K Rec zu A3G konnte bereits gezeigt werden. Allerdings konnte dies für das HIV-Rev bei Versuchen im Rahmen dieser Bachelorarbeit nicht bestätigt werden. Ebenso konnte keine Colokalisation mit TIA-1, einem Stressgranula-Markerprotein gezeigt werden.
Weiteres Ziel dieser Arbeit ist die Aufreinigung von Staufen-1- und HERV-K Rec-Protein. Dies soll die Vorarbeit für eine entsprechende Antikörpergenerierung darstellen und konnte für das Staufen-1 erfolgreich realisiert werden.
Eine Aufreinigung des HERV-K Rec war trotz Versuchsoptimierung aufgrund der Bildung sogenannter „Inclusion Bodies“ nicht möglich.
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